DNA測試有助追蹤食物中毒
沙門氏菌是革蘭氏陰性厭氧細菌。 圖片來源:Public Health Image Library 澳大利亞新南威爾士大學研究人員報告了一種靈敏而特異的檢測沙門氏菌的方法,為直接從標本中快速鑒定血清型鋪平了道路。這種對現有檢測方法的改進可以在快速追蹤感染源方面發揮關鍵作用。該報告4月28日發表於《分子診斷學雜誌》。
DNA測試有助追蹤食物中毒 |
沙門氏菌是革蘭氏陰性厭氧細菌。 圖片來源:Public Health Image Library
澳大利亞新南威爾士大學研究人員報告了一種靈敏而特異的檢測沙門氏菌的方法,為直接從標本中快速鑒定血清型鋪平了道路。這種對現有檢測方法的改進可以在快速追蹤感染源方面發揮關鍵作用。該報告4月28日發表於《分子診斷學雜誌》。
數據顯示,在美國由沙門氏菌引起的食物中毒每年影響135萬人,導致26500人住院、420人死亡。因此,快速又簡單地檢測特定類型細菌,對公共衛生調查人員追蹤食物中毒源頭非常重要。臨床或食品樣本中的沙門氏菌數量通常非常少,因此需要非常敏感的方法進行檢測。
多重交叉置換擴增(MCDA)是一種可以快速檢測極少量DNA的方法,而且也可以在單一恆溫條件下進行,這與聚合酶鏈式反應(PCR)等其他方法所需的溫度循環形成了對比。這使得它很適合簡單、快速、敏感的細菌檢測。儘管已經有了針對沙門氏菌的MCDA檢測,但它並不能區分不同的血清型。
研究人員開發了針對沙門氏菌7個亞型特異性靶點的MCDA分析。所有這些檢測都能準確檢測到10份DNA拷貝,並在大約8分鐘內產生結果。重要的是,這些檢測不需要專門的檢測設備,簡化了未來在臨床或工業環境中的應用。研究人員表示,將這7種血清特異性檢測方法與現有檢測方法結合,可以簡化和加速沙門氏菌檢測。
研究人員表示,這項研究開發的檢測方法,所用的基因標記是在分析數千個基因組的基礎上選擇的。此外,雖然沙門氏菌血清有數百種,但研究人員選擇了在澳大利亞最常見的5種,它們導致了該國超過85%的沙門氏菌感染。這些血清中至少有兩個也是世界上沙門氏菌血清中數量最多的,因此研究人員認為,這一結果適用於其他地區。
沙門氏菌通常生活在動物和人類的腸道內,並通過糞便傳播。沙門氏菌中毒的可能癥狀包括噁心、嘔吐、腹部絞痛、腹瀉、發燒和頭痛。
相關論文信息:http://dx.doi.org/10.1016/j.jmoldx.2020.02.006